科研 | Nature子刊（IF：17.745）：粪菌移植版后细菌菌株的精确定量描述了长期移植版情况并解释了结果

人类所学的工具只能要非常深入的核酸来伪装成用到标记基因中都的单核苷酸多态病态（SNPs）的菌株，且不将芽孢建模为三组成员未确定的均值菌株，其主要交换与FMT取样两者之间交换裕真神核人类所成品病原体片段或SNPs涉及的不可全面性推定。如果我们要理解FMT期两者之间菌株的传播者和孕育巴雷特引理的满足可能，那么将病原体遗传变异与一个均值的单元（即培养单单来的病原体分开若无）联系起来是至关关键的。

为了借助粗略的菌株搜寻，我们整合了一种核酸的融合工具，首先用到已发同上的工具对FMTNADP和酶的菌株顺利完成培养单单来和核酸，然后用到本文介绍的总和工具在裕真神核人类所取样中都搜寻这些菌株，我们将其命叫作Strainer。

结果

1 策划者、培养单单来和核酸的FMT菌株的搜罗

我们从7名FMT有益NADP和13名罹患病态CDI 的FMT酶中都分开了2,987株病原体，分别代同上1008株鲜明菌株（207个种），并顺利完成了全真神核人类所核酸（同上1、三幅1和多余同上1、8、9）。与我们之在此之前的分析完全相同，全真神核人类所类似于度<96%的病原体分开若无被假定为鲜明菌株；否则，它们被认为是代同上菌株的多个分开株。我们从使用FMT的7个NADP唾液取样和FMT在此之前及FMT后为时5年的酶取样中都，对85个裕真神核人类所的取样顺利完成了核酸。正如之在此之前的研究成果，这些培养单单来的菌株代同上了几乎的裕真神核人类所，70%（标准化差=16%）的病原体裕真神核人类所飞行中映射到培养单单来的菌株真神核人类所上。我们还通过将人类所唾液灌胃到冷藏血清（n=9），对血清唾液取样顺利完成裕真神核人类所学研究成果，来分析报告我们培养单单来的病原体菌株库的全面病态。我们培养单单来的病原体菌株组成员解读了涉及人类所唾液定植的冷藏血清中都很低达 90% （标准化差 = 9.2%; 拓展图同上三幅1b） 的病原体飞行中，同上明人类所取样中都大多数无法解读的病原体裕真神核人类所学飞行中来自不可培养单单来的涉及联（可有如，来自食若无和自然生态系统中都的死亡病原体），或者系统地无法在血清肾脏中都生长。

同上1 NADP和酶的取样。

7可有NADP为13可有罹患病态CDI或同时脑癌罹患病态CDI和IBD的病症交换FMT。对所有唾液取样顺利完成唾液裕真神核人类所学研究成果。NADP菌株从所有NADP分开，并随一段时两者之间推移伪装成反之亦然酶的裕真神核人类所。在FMT在此之前后也从多于数酶中都分开单单了菌株。M和C同上明裕真神核人类所学或培养单单来分别在指明的一段时两者之间点顺利完成。尝试同上明该病症无法罹患。a样品在移位FMT后采集（由于FMT初始回退）。

三幅1 FMT研究成果内部设计阐述，包括NADP、酶和对唾液取样顺利完成裕真神核人类所核酸和病原体菌株培养单单来的一段时两者之间点。

2 Strainer迭代的整合

能用裕真神核人类所学图同上顺利完成菌株搜寻的核心挑战是未确定三组成员来自病原体真神核人类所的讯息序四支构造或称k-mers，可以实质上地鉴别任何特定的菌株。由于每个类群包含许多密切涉及的相异菌株，它们交换几乎的真神核人类所概要（拓展图同上三幅1c），因此，鉴别搜寻菌株所只能的讯息构造是一个挑战。我们通过去除那些与病原体真神核人类所和唾液裕真神核人类所广泛交换无关的、非同源生殖的k-mers（k = 31），来鉴别菌株最有价值的k-mers，在这种可能下，消失同一菌株的概叛将非常偏很低（多余同上1和拓展图同上三幅1d；我们迭代的阐述推断在拓展图同上三幅1e中都）。之后，我们将裕真神核人类所学样品中都的每个核酸飞行中分配给一个鲜明的菌株，工具是将飞行中上的k-mers分布与先在此之前为该菌株未确定的讯息病态k-mers顺利完成来得。之后，我们将一个菌株的指明飞行中映射到其真神核人类所上，以修正核酸深度和覆盖叛将的均匀病态。之后，我们来得了裕真神核人类所取样中都某一菌株与不涉及取样菌株的相异右方飞行中的生产量，并对该菌株的存有顺利完成了置信度分数。

3 Strainer对冷藏血清未确定病态种群的证明了

我们检测了Strainer准确探测病原体菌株的意志力，分别从3个相异的人类所唾液取样和10个普通人类所肾脏少用孕育病原体倒卵形拟芽孢Bacteroides ovatus的10个鲜明菌株的姪之之外都分开病原体的准确培养单单来若无（三幅2a和多余同上2），左至右给冷藏血清灌胃。我们用粗略度和改派叛将来全面性我们在这些简便种群中都的总体而言同上现，粗略度和改派叛将分别为100%和86.9%，在280种相异的检测中都无法消失有假阳病态（甲基化100%）。

三幅2 Strainer能准确探测肾脏芽孢中都的病原体菌株。a. Strainer能从冷藏血清中都分开倒卵形拟芽孢B. ovatus菌株。每四支代同上一个实质上的冷藏血清，用特定的倒卵形双歧芽孢B. ovatus菌株灌胃，有或无法相异的人类所肾脏病原体培养单单来漫画版菌株。菌株F和G分别包含在人类所漫画版1和2中都。人类所培养单单来漫画版3不含倒卵形双歧芽孢B. ovatus，而其余的倒卵形双歧芽孢B. ovatus分开株是从其他人类所唾液取样中都分开单单来的。绿色框同上示该菌株被加进血清精子并在裕真神核人类所学中都探测到（真神阳病态）；灰色同上示仍未探测到菌株（真神阴病态）；橙色同上示探测到菌株但仍未加进（有假阳病态）；黄色同上示仍未探测到菌株，但在血清中都顺利完成了灌胃（仍未知，因为灌胃菌株并不平常加剧平稳的定植）；b. 基于SNP推定的菌株探测迭代ConStrains、Strain Finder、inStrain和我们的Strainer工具在探测冷藏血清中都B. ovatus菌株生产量上的同上现；c. 粗略-改派切线，分析报告基于SNP推定的菌株搜寻工具和Strainer在真神实图同上集上的同上现，这些图同上集包括在冷藏血清中都年中灌胃三组成员未确定的菌株、FMTNADP酶一对一以及随一段时两者之间在有益生殖中都伪装成菌株平稳病态；d. 对于Strainer将菌株与分开单单来样品的裕真神核人类所近似于的意志力顺利完成病态能分析报告。实线同上示将我们的迭代应使用从有益对应中都分开的261株菌株后相异核酸深度的结果。蓝色同上示250万（M）飞行中的核酸深度，而虚线同上示在从罹患病态CDI病症中都分开单单的56株菌株上应用领域Strainer后的结果。虚线切线是来自IBD病症的54株菌株。粗略改派切线的AUC如三幅所示。

4 Strainer的比起于检测

我们从反之亦然的和裕真神核人类所核酸的FMT取样中都分开单单的菌株图同上集，这为严格来得裕真神核人类所学中都搜寻SNP菌株全权负责的基于SNP的推定工具交换了一生殖内检验基础。我们在冷藏血清图同上集上检测了先在此之前发同上的Strain Finder、ConStrains和inStrain迭代。这些SNP全权负责迭代是在模拟和体之外图同上集上整合的，比我们基于详见的工具多了一个挑战，即它们必须首先从裕真神核人类所图同上本身推定单单菌株。任何无法推定单单的菌株都会加剧整个图同上集的有假阴病态，任何推定错误的菌株都会在任何被错误探测的取样中都传播者有假阳病态。因此，我们首先检测了每种迭代少于每只血清中都倒卵形拟芽孢B. ovatus菌株的应该生产量的意志力。然而，所有的迭代都难以做到这一点，而Strainer的探测结果与灌胃血清精子倒卵形拟芽孢B. ovatus菌株生产量也就是说原则上（三幅2b，Strainer的R2 = 0.99）。然后，我们检测了这些推定的菌株是否与灌服给冷藏血清的菌株近似于。为此，我们为每个菌株（来自其纯培养单单来若无）交换了仍未成品的更早核酸飞行中（将近210万），作为一个鲜明的裕真神核人类所“真神实”取样，并未确定是否有任何迭代可以将这些仍未成品的菌株飞行中与应该的裕真神核人类所学取样近似于。这些迭代都无法做到这一点（三幅2c），但inStrain可以应该鉴别来自相异菌株真神核人类所的仍未成品飞行中。在这项研究成果中都，ConStrains和Strain Finder迭代的增益为0，而inStrain的增益为10.1，我们的工具为88.7。所有的迭代都无法消失有假阳病态。

5 Strainer对多样体液肾脏芽孢的证明了

为了在更加本质和具挑战病态的可能下分析报告Strainer，我们之后在几个多样的人类所肾脏芽孢种群中都顺利完成了检测，这些种群的类群分开度很很低，但几乎无法菌株分开。这类似于FMT的应用领域案可有，即必须在多个生殖中都粗略探测有可能传播者的病原体菌株，同时将其与同一类群的其他涉及孕育菌株顺利完成区分。我们对10个不涉及的生殖的唾液裕真神核人类所以及从完全相同的唾液取样中都分开单单的261个病原体菌株的真神核人类所顺利完成了核酸（多余同上3），然后分析报告了Strainer在应该的生殖裕真神核人类所中都探测这些菌株的意志力，同时在其他9个取样中都会错误地探测到它。在每个样品有1000万条裕真神核人类所飞行中的可能下，我们远超了93.9%的粗略度，改派叛将为72.4%，切线下面积（AUC）为0.86（三幅2d）。尽管我们在更加深的裕真神核人类所学中都远超了略很低的改派叛将，但即使是50万个裕真神核人类所核酸飞行中也足以远超95.8%的弹道，改派叛将为57.6%（三幅2d）。我们从5名罹患病态CDI病症和4名肠易激症（IBD）病症中都诱发了类似的检测图同上集（多余同上4和5），注意到罹患病态CDI的AUC略很低，因为罹患病态CDI的肾脏纤人类所组成员的多样病态偏很低（三幅2d）。虽然我们报告了较很低的总体而言AUC，但一些形态学顺序比其他形态学顺序更加容易探测（多余同上6），对于可视详见真神核人类所生产量多于的类群，以及通过很低选项病态培养单单来钼分开的类群，其病态能受到冲击，因为培养单单来比裕真神核人类所学更加敏感。总之，这些结果同上明，我们的迭代可以准确地伪装成裕真神核人类所中都已核酸的病原体菌株，从而可以全面性均值NADP菌株在FMT中都的传播者。

6 罹患病态CDI病症的FMT菌株动力学

在一个医学队四支中都（三幅1和同上1中都的FMT研究成果内部设计阐述），6个FMTNADP各自向一个酶交换他们的取样，在FMT后的多个一段时两者之间点顺利完成取样，而有1个NADP向7个相异的病症交换取样。

以在此之前的工具现在证明了，在罹患病态CDI中都，NADP和酶之两者之间在FMT后交换芽孢，但对移植版的粗略全面性仍仍曾就。我们用到Strainer测量NADP菌株在酶中都的移植版可能，并将NADP菌株的移植版比叛将（PEDS）量度假定为FMT后酶中都探测到的NADP菌株生产量相乘从NADP中都分开单单的菌株总数。我们在FMT后对10名仍未罹患的酶顺利完成了为时5年的搜寻，注意到NADP菌株的移植版可能原则上且平稳（三幅3a和拓展图同上三幅2a中都的NADP-酶对姪的生殖原点）。在这些生殖中都，我们报告了36小时的平均值移植版叛将为83%（标准化差=9%），8时为平稳在71%（标准化差=16%）（通常注意到的量度抗菌的医学站起），即使5年后也一直保持在71%（标准化差=9%）的很低水平，同上明FMT对肾脏芽孢的操纵者可以加剧三组成员平稳的NADP病原体菌株在罹患病态CDI病症中都近乎永久地内嵌。隶属双歧芽孢Bifidobacteriales目的菌株在8时为移植版叛将很偏很低（67%），而拟芽孢Bacteriodales目的菌株移植版叛将较很低（92%，拓展图同上三幅2b）；我们很多于观察到来自乳酸芽孢Lactobacillales目的移植版。

我们注意到51个仅指拟芽孢Bacteroidales目的菌株中都，有50个在8首日移植版的菌株在6个月或更加长的一段时两者之间仅限于近十年保持（拓展图同上三幅2c）。然而，仅指双歧芽孢Bifidobacteriales目的菌株中都，在8时为移植版，在6个月或更加长的一段时两者之间仅限于近十年保持的较多于（11个中都只有5个，P

三幅3 酶的FMT菌株为时5年的动态。a.来自NADP的菌株（n = 6个人类所实质上取样）在移植版后尝试的FMT病症（n = 13个人类所实质上取样）中都近十年保持的移植版至多于5年。每个一段时两者之间点的图同上以平均值值±s.e.m同上示；b. 在FMT之在此之前从酶身上分开单单来的菌株（n = 7个人类所实质上取样）促使消失，有一小部份在较长的一段时两者之间仅限于不间断存有。每个一段时两者之间点的图同上以平均值值±s.e.m同上示；c. 在FMT后的病症中都探测到的NADP、酶和自然生态系统菌株的比叛将。自然生态系统菌株在涉及联上认NADP和非酶（在FMT之在此之前），在FMT后顺利完成培养单单来和裕真神核人类所探测；d. FMT后病症中都探测到的菌株生产量，按主要亲缘形态学群（目级）形态学，并根据其涉及联渐变。

7 通过培养单单来证明了病原体菌株的移植版可能

FMT后对NADP和酶的菌株顺利完成分开和核酸是对孕育巴雷特引理的证明了。通过培养单单来证明了来自多个类群和相异FMT干预采取措施的NADP病原体菌株的传播者，除了证明了孕育巴雷特引理之外，还可以交换额之外的移植版证据。因此，我们还培养单单来了5个酶在FMT在此之前后的菌株（三幅1a），并将其与NADP的菌株三组成员顺利完成来得，以检验证明了病原体菌株的传播者。在FMT之在此之前，我们从仍未在任何酶中都分开单单NADP菌株；然而，在FMT之后，我们在酶中都分开单单48个NADP菌株（多余同上7），包括16个相异多样。如果我们用相异的迭代对这些在NADP和酶中都分开的标准化菌株的迭代搜寻病态能顺利完成全面性，我们的FMT搜寻工具的总体而言增益为92.9（有1个有假阳病态），而inStrain为25.3，Strain Finder为0，ConStrains为1.4（三幅2c）。对于平行培养单单来的取样的搜寻，即在一个有益人的多个一段时两者之间点上，我们的迭代的总体而言增益为96.6（无法有假阳病态），而inStrain为21.8，Strain Finder为0，ConStrainins为3.4。通过对体液的、经检验证明了的菌株传播者图同上集的来得，证明了了Strainer优于现有的工具。

8 原有的派驻菌株被FMT过渡到

一些研究成果同上明，派驻的纤人类所菌株创造了自然生态位，这反过来又会冲击NADP病原体在FMT后的移植版。因此，未确定FMT在此之前的病原体菌株并了解它们在移植版后的不间断动态变化至关关键。我们在7个酶中都分开并核酸了FMT在此之前的派驻菌株，并在每个酶的裕真神核人类所中都对它们顺利完成了为时5年的搜寻。与PEDS量度类似，我们将酶菌株的不间断病态比叛将（PPRS）假定为FMT后观察到的酶菌株与FMT在此之前培养单单来的总酶菌株之两者之间的比叛将。与NADP菌株的并能很低移植版可能相异，我们注意到PPRS的升很低更加为二阶（三幅3b和拓展图同上三幅2d中都NADP-酶对的生殖原点），总体而言不间断病态在1时为升很低到49%（标准化差=28%），8时为升很低到21%（标准化差=10%）（P<0.02，Wilcoxon检验）。仅指双歧芽孢Bifidobacteriales目的酶菌株平常在FMT后的8首日不间断存有（7个）。然而，乳酸菌Lactobacillales目和肠芽孢Enterobacterales目的酶菌株也就是说上被FMT消除了。在以在此之前的研究成果中都，我们主要观察到酶肾脏芽孢的不平稳病态；然而，我们的工具同上明，更早菌株的一个姪集仍然持久地定植状态。

9 FMT后非NADP菌株的移植版

我们之后调查了NADP和FMT在此之前酶肾脏菌株的自然生态位征用可能。我们分开并搜寻了5个FMT后的菌株，注意到了24个非NADP和非酶的菌株，这些菌株在FMT后的酶中都被裕真神核人类所探测并培养单单来单单来。平均值而言，FMT后的病症中都，8.9%的菌株来自FMT在此之前的酶，79.6%的菌株来自NADP，11.5%的菌株认NADP或非酶涉及联的（三幅3c）。虽然它们的涉及联和重新分配方式不详，但这些自然生态系统菌株仅指FMT在此之前在有益NADP和酶中都探测到的系统形态学（三幅3d），其定植模式类似于（拓展图同上三幅2f）。这些结果同上明，大将近11.5%的酶自然生态位空两者之间被其他涉及联的菌株平稳地定植，假定的来生体人类所放射治疗产品（LBPs）的自然生态位占有叛将更加有限，所以只能要获取更加多的自然生态系统纤人类所使得宿主完全定植。另之外，这些人类所有可能代同上了在移植版在此之前在NADP和酶中都偏很最低探测或培养单单来极限的菌株，尽管这或许不太有可能是所有菌株的可能，因为许多是来自我们的比起于中都弹道和改派叛将非常很低的形态学组成员（三幅3d）（多余同上6）。

10 NADP移植版解读了罹患病态CDI FMT的医学结果

FMT干预采取措施通常在FMT后的8时为两者之间点时分析报告抗菌，即来得远超医学站起的病症和仍无法远超站起的病症的生产量。PEDS为了解FMT的医学尝试或罹患交换了一个潜在的全面性代用标志若无。在本队四支中都的两名在FMT后8首日最初罹患的病症中都，我们注意到与尝试远超FMT后8周无CDI罹患的医学站起的病症相比，PEDS有所提高（三幅4a，P=0.03，铰Wilcoxon检验）。这同上明，NADP菌株在酶中都的粗略移植版可以实质上解读FMT干预的最初医学结果，因为生殖可以通过17%的PEDS值完美地分为罹患或不罹患。

三幅4 NADP内嵌解读罹患病态CDI FMT的医学结果。a. 8时为的PEDS可以计算罹患病态CDI病症（n = 13个人类所实质上取样）FMT的最初罹患。铰Wilcoxon检验使用少于总和显着病态；b. PEDS量度可以阐明的大FMT后罹患CDI的病症移位FMT的尝试结果；c. 我们的工具对实质上纪录所有可视FMT取样的计算意志力。每当我们报告医学尝试时，注意到内嵌叛将很最低17%的值（n = 19 个真神阳病态）和1个有假阴病态。医学罹患平常与偏很低内嵌叛将（n = 2 真神阴病态）实质上涉及，无法有假阴病态；d. 在多个酶中都平稳移植版的很低传播者病态菌株中都，菌株的移植版和鉴别。在此之前4四支是来自NADP每周的裕真神核人类所取样，而第5四支是5年后的NADP取样。之后的6四支来自无法最初罹患的FMT须先。之后一四支来自5年后的一位酶。Strainer使用从相应的裕真神核人类所学取样中都找单单每种病原体菌株的存有（绿色）或不存有（黄色）可能。

经验病态的医学结果同上明，不感兴趣移位FMT的人并不一定在第二次就做单单反应。之后，我们分析报告了我们的PEDS量度是否能阐明这些病症移位FMT的结果。两名最初失败的酶（R095和R311）不感兴趣了移位口服的FMT，并在仍未来的一段时两者之间点（包括R095的5年后）报告了医学尝试（即无法罹患CDI罹患）。移位用药后，PEDS明显升很低（三幅4b）。

由于PEDS都能解读病症移位FMT的罹患和的结果，我们分析报告了我们工具对所有可视的FMT取样的总体计算意志力，其中都医学分析报告是实质上纪录的（三幅4c）。每当我们报告医学尝试（即无法罹患）时，我们注意到移植版叛将很最低17%的值（n = 19个真神阳病态），有1个有假阴病态。或多或少地，医学罹患平常与偏很低移植版叛将实质上涉及（n = 2个真神阴病态），无法有假阴病态。总之，这些结果同上明，在任何一段时两者之间点上，NADP菌株的移植版叛将都是一个准确和稳健的量度（粗略度=100%，增益=95%），可以实质上解读FMT的医学结果，且无论是的大FMT还是移位FMT后。然而，加剧病症FMT不尝试的很偏很低移植版叛将的原因仍不清楚。

R285号病症在本来尝试的FMT中都消失了非常偏很低的移植版叛将，而且无法罹患（拓展图同上三幅3）。该病症的报告推断，在第30天时移植版叛将很低达77%，第58天时为72%，第300天时减多于到4%，5年后再次提高到72%。该病症在2个月和5年后都无法病征，这与顾虑到原则上，因为在这些一段时两者之间点有较很低的移植版叛将，这就是为什么偏很低移植版叛将最初引人不快。然而，该病症在FMT后第258天因严重冲击腹泻和用到类固醇而单单院，这也许解读了他们的裕真神核人类所在第300天测得的偏很低PEDS，尽管这同上明他们的纤人类所组成员在42天的比起较长的一段时两者之间内无法恢复。关键的是，这个人无法受到移位FMT，这同上明FMT后第300天的很偏很低移植版叛将加剧几乎移植版的菌株减多于到我们迭代的探测极限以下，但引人印象钦佩的是，它们并无法从肾脏中都消除。

11 为未确定的来生体病原体放射治化学疗法选项病原体菌株

对FMT顺利完成粗略分析，以未确定可使用放射治疗罹患病态CDI的可培养单单来的鲜明菌株，为选项最小的融合病原体交换了种系统，使用未确定的LBP可作为FMT的更加安全和和可拓展的偏很低成本。能用我们的系统病态和Strainer，我们未确定了经体液检测的NADP唾液芽孢的可培养单单来移植版部份和仍未移植版的菌株。假定的LBPs很关键，因为它们比FMT更加具可拓展病态，并减多于了将多重致病人类所体传播者给酶的机会，而常规FMT不能忽略这种风险。NADPD283被使用多个（n=5个非罹患）酶，因此为我们交换了更加多的意志力来探测单一菌株的移植版原则上病态（三幅4d）。我们关注那些在D283的5个非罹患酶中都至多于有4个能平稳移植版的很低传播者病态菌株，注意到那些仅指病原体目的菌株平常能移植版（100%，19个中都的19个，甚至为时5年），这同上明这些菌株和其他在尝试放射治疗的病症中都能平稳移植版更加长一段时两者之间的菌株，有可能被用来放射治疗LBPs。我们交换了一份来自所有NADP的类群概要，以及每个类群的菌株在酶中都移植版的频叛将（同上2）。这些移植版的菌株和类群交换了有效的成分，可以在仍未来的试验中都选项用到。

同上2 ；也移植版的类群概要。

根据其在相异酶中都的培养单单来和移植版视觉效果，对一套使用LBP的菌株顺利完成确认。“NADP生产量”完全相同的是该类群的菌株被培养单单来或裕真神核人类所探测的NADP。“培养单单来的菌株数”代同上该类群培养单单来和裕真神核人类所探测的鲜明菌株。“重新分配到的酶生产量”完全相同于不感兴趣该类群菌株的FMT酶生产量（对该类群培养单单来的每个菌株分别计算）。“移植版到受者精子的菌株生产量”代同上在受者精子移植版至多于8周的菌株（一个少用的医学站起）。“移植版视觉效果”的计算工具是“菌株移植版”（第5亦同）和 “重新分配到的酶”（第4亦同）的比叛将。在本研究成果中都，我们只顾虑有2个或更加多菌株在酶中都移植版的病原体多样。

讨论

我们整合了Strainer迭代来搜寻裕真神核人类所核酸图同上之之外都的核酸病原体菌株。混合核酸菌株培养单单来和13对NADP和酶在多个一段时两者之间点的裕真神核人类所核酸，我们对现有的迭代顺利完成了严格的比起于检测，结果推断，大多数FMTNADP菌株（>70%）和多于数酶菌株（<25%）在非罹患病症的FMT后至多于保留5年。这些结果同上明，FMT代同上了对宿主芽孢的半永久病态改变，即一种来自单次给药的明显的持久病态放射治疗，其平稳病态与有益对应组成员类似于。我们的结果同上明，PEDS是FMT尝试和CDI罹患的计算采取措施。虽然尝试的FMT与NADP菌株的很低移植版叛将有关，但这种移植版是由来自一个形态学组成员的菌株促成的，这些菌株的移植版叛将非常好，与以在此之前的研究成果原则上，并同上明特定的菌株组成员决定了FMT干预的近十年结果。

我们承认，我们的工具依赖于培养单单来的病原体菌株的核酸可能，这些菌株通过裕真神核人类所顺利完成探测和伪装成。核酸菌株培养单单来和分开的工具早就基础上，但仍然受到成本、一段时两者之间和某些类群的纤人类所培养单单来难度等因素的限制。我们的工具最适合于用到一个NADP或一个为许多酶用到未确定的LBP的化学疗法。如果为相异的放射治疗领域整合单单与FMT等疗的LBPs，这将有可能是最主要的可能。此之外，我们研究成果中都的精子菌株真神核人类所和裕真神核人类所比起于，混合并能提高的病原体真神核人类所生产量来更加好地假定每个类群的全真神核人类所，有可能促进迭代基础上或反之亦然的发展，使用培养单单来实质上的菌株伪装成。

我们研究成果框架的全面性病态质可使用指导肾脏纤人类所芽孢转换研究成果内部设计，超单单医学抗菌。可有如，如果口服FMT胶囊与结肠镜下输注NADP材料的移植版和结果类似于，那么仍未来的研究成果内部设计有可能依赖于侵入病态较小的口服给药。一些FMT试验用到了数首日的多次移植版，我们的框架和迭代可以准确分析报告移植版的现金流，以未确定移位口服的成本/效益。

近期，FDA发布了多个安全和日本气象厅，包括FMT的用到和因FMT所用唾液材料中都的多重致病人类所体传播者而加剧的严重冲击不当血案风险。我们研究成果的一个关键结果是未确定了一种精选辑的来生菌株融合若无，这些菌株在FMT后无病征的病症中都可平稳移植版5年。这些菌株是小分姪不含多重致病人类所体的LBP的理想起点，可以作为罹患病态CDI的FMT偏很低成本。

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